Nhiệm vụ chuyên môn của Khoa bao gồm:

- Điều trị các bệnh lý bề mặt nhãn cầu như: loét giác mạc, viêm kết mạc, các khối u vùng mắt, viêm tắc lệ đạo, tạo hình thẩm mỹ,…

- Phối hợp công tác chỉ đạo tuyến: tập huấn chăm sóc mắt ban đâu cho tuyến y tế cơ sở, chuyển giao kĩ thuật,…

- Đào tạo tại chỗ : sinh viên thực hành, cầm tay chỉ việc cho các bác sỹ tuyến huyện.